红豆杉腐霉病病原属真菌鞭毛菌亚门，营养体多数为无隔菌丝体，少数为原质团，无性繁殖产生游动孢子；有性生殖产生卵孢子或休眠孢子。孢子囊球状，萌发时产 生泡囊；原生质转入泡囊内形成流动孢子，藏卵器内含一个卵孢子。此菌能在冷湿环境中浸染危害，也能在天气炎热潮湿时猖獗流行。当高温、高湿时，它的发病率 高。此病5~8月发病最严重。土壤含氮量高，可加重此病的发生。
        症状
      植株最直观的表现就是根茎腐烂。在南方红豆杉上，此病在植株根、茎上都有发生，属于软腐中的根腐和茎腐，地上部份枯死而不倒状，也称为立枯。一般表现为霉状物，但在病部很难发现霉状物。

      传播途径
     土壤和病残体中的卵孢子是最重要的初侵染源，人工作时的工具和人携带病原物极易传染。此病在南方红豆杉上表现为零星状分布。

防治方法
     可以用甲霜灵锰锌加75%百菌清500~1000倍液喷雾防治；也可混入一些微量元素，以增加植株本身的抗病性。针对病情可逐渐增加药剂量。一般7~15天喷施一次，病情严重时可缩短至4~5天一次。

红豆杉腐霉病和红豆杉立枯丝核病区别 
    外观诊断上，立枯丝核病表现青枯属萎蔫的一种，就是叶片脱水，叶片含叶绿素；病株从侵染到显现时间很短。腐霉则显现为立枯；地上部份是慢慢失水黄化枯死， 且主根病斑是水渍状小斑点，表面软腐；侧根发病后褐变而腐烂。而立枯丝核病在主根和侧根上有明显的白色索状物，而且布满病株的茎和根。 
    病原物内部结构看，腐霉病营养体的菌丝体是无隔的，而立枯丝核病营养体的菌丝体是有隔的白色索状物。立枯丝核菌有性繁殖产生坦孢子，腐霉病有性繁殖产生卵孢子。